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PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体) Linker的设计与优化
发布时间:2024-05-06     作者:kx   分享到:
  • 设计:

PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体)Linker的设计是非常关键的,因为它连接了两个功能分子:靶标蛋白的抑制剂和E3泛素连接酶结合部分。

Linker的设计需要考虑以下几个方面:

  1. 长度和柔性:Linker的长度和柔性会影响两个功能分子之间的相互作用。通常,较长且柔性的Linker有助于两个功能分子的结合。

  2. 稳定性:Linker需要具有足够的稳定性,以保持功能分子的结合并在细胞内发挥作用。同时,也要避免过度稳定导致结合部分无法释放。

  3. 水溶性:由于Linker需要在细胞内发挥作用,因此具有一定的水溶性是重要的。

  4. 化学反应性:Linker可能需要具有特定的化学反应性,以便在合成过程中或在细胞内的特定环境中实现其功能。

  5. 非特异性效应:避免Linker本身对细胞或其他蛋白质产生非特异性影响。

  6. PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体) Linker的设计与优化

  • 优化:

对PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体)Linker进行优化是提高其活性和选择性的关键。优化的方法包括以下几个方面:

  1. 长度和柔性:调整Linker的长度和柔性,使其能够有效连接靶标蛋白抑制剂和E3泛素连接酶结合部分。合适的长度和柔性可以促进功能复合物的形成和稳定性。

  2. 稳定性:优化Linker的稳定性,使其在细胞内不易降解或受到其他反应影响,从而提高PROTAC的持久性和效果。

  3. 水溶性:增加Linker的水溶性,有助于在细胞内更好地分布和发挥作用。

  4. 特异性:确保Linker具有足够的特异性,只在靶标蛋白和E3连接酶之间形成复合物,避免与其他蛋白质发生非特异性结合。

  5. 化学反应性:根据需要调整Linker的化学反应性,以实现在合成和细胞内的特定环境中的功能。

  6. 毒性:评估Linker可能的毒性和副作用,确保在使用时对细胞和生物体没有不良影响。

PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体) Linker的设计与优化

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