UDP糖|udp - n -乙酰氨基葡萄糖焦磷酸化酶的结构基础及防治埃及伊蚊的潜力萜类化合物的鉴定
发布时间:2022-02-17     作者:UDP糖   分享到:
以埃及伊蚊几丁质代谢中发挥重要作用的udp - n -乙酰氨基葡萄糖焦磷酸化酶(Aa-UAP)为靶点,以天然萜类化合物为靶点,为开发新型杀虫剂提供了一个生态友好的候选靶点。
通过比较同源性方法构建了三维Aa-UAP结构,并对其进行了验证,然后对天然MDP3和NPACT数据库中的1000个萜类化合物进行了基于结构的虚拟筛选。
通过分子动力学(MD)模拟和结合自由能分析来阐明复杂分子间的稳定性和亲和力随模拟时间的变化。结果表明,Aa-UAP具有同二聚体状态,其活性位点残基保存良好。
三个化合物(NPACT00138, NPACT00452和NPACT00839)被优先考虑,因为它们与Aa-UAP的活性结合位点残基建立了保守和稳定的相互作用。
结果表明,所报道的Aa-UAP特异性萜类化合物可作为开发潜在杀虫剂的先导化合物。重要的是,FDA批准的**NPACT00839(紫杉醇)可以进一步用于生物优化的快速实验测试管道。
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