CY5-COOH，即花青素CY5-羧基，是一种带有羧基（-COOH）功能团的Cy5荧光染料。

结构特点：

CY5-COOH具有Cy5染料的荧光特性，同时带有一个活性的羧基基团。

该羧基基团可以与氨基基团反应，通常通过活化形成酰胺键，从而实现与生物分子的共价连接。

应用：

：CY5-COOH可用于标记蛋白质、肽链、寡核苷酸等生物分子，用于荧光显微镜、流式细胞术和其他检测方法中。

分子探针开发：由于其红色荧光特性，CY5-COOH是分子探针的理想选择，特别是在多重标记实验中与其他荧光染料结合使用。

生物成像研究：CY5-COOH的长波长发射信号非常适合用于深层组织成像，并能够减少背景干扰，因此常用于体内研究中的荧光成像。

使用注意事项：

在进行前，需要对CY5-COOH进行活化处理，以形成活化酯，提高其与氨基的反应活性。

标记过程中应控制反应条件，避免高温和强酸强碱环境，以保证标记效率和产物的稳定性。

标记后的产物应进行纯化，以去除未反应的荧光染料和副产物，确保实验结果的准确性。

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