Cyanine3.5 carboxylic acid，也被称为Sulfo-Cyanine3.5 carboxylic acid或Cy3.5-COOH，同样是一种重要的荧光染料。

基本信息：

中文名称：磺酸基花青素CY3.5羧基、磺酸基花青素CY3.5羧酸

英文名称：Sulfo-Cyanine3.5 carboxylic acid、Cyanine3.5 carboxylic acid

CAS号：1144107-79-8（内盐）

分子式：C38H41ClN2O2（非磺化形式）；C38H37N2K3O14S4（磺化形式）

分子量：593.20（非磺化形式）；991.26（磺化形式）

物理性质：

外观：深紫色固体（非磺化形式）；深绿色固体（磺化形式）。

溶解度：易溶于DMF、DMSO等有机溶剂；在水中有较好的溶解性（磺化形式）。

激发波长：561nm或594nm（非磺化形式）；576nm（磺化形式）。

发射波长：603nm（磺化形式）；604nm（非磺化形式，PBS缓冲液）。

化学性质：

Cyanine3.5 carboxylic acid含有羧基（-COOH）官能团，这使得它可以进行进一步的化学修饰，如与NHS（N-羟基琥珀酰亚胺）等活性基团反应。

应用：

Cyanine3.5 carboxylic acid作为荧光染料，在生物学研究中具有广泛的应用。它可以用于标记细胞、组织中的特定分子，如蛋白、抗体等。

在流式细胞术中，Cyanine3.5 carboxylic acid可用于细胞分类和计数。

在荧光显微镜中，Cyanine3.5 carboxylic acid可用于观察细胞结构和功能。

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